Unterschiedliche Klangqualität von Rippingsoftware

Hintergrund: Ich habe viele meiner CDs mit Media Monkey als .flac gerippt, als Netzwerkplayer nutze ich SONOS. Ich bin soweit mit allem zufrieden, möchte aber sicherstellen, das mein Ausgangsmaterial, eben die Musikdateien im FLAC-Format, in optimaler Qualität gespeichert sind.
Bisher habe ich das mit Media Monkey (Gratis) gemacht und bin soweit zufrieden, vor allem, was die Benennung der Dateien angeht. Wenn nun aber die Klangqualität von EAC (ebenfalls gratis) deutlich besser ist, möchte ich möglichst früh umsteigen.
Bei meiner Anlage habe ich beim Schnelltest noch keine Unterschiede hören können - meine Anlage ist vom ersehnten High End-Klang leider auch weit entfernt - was sich in Zukunft ändern soll. Und dann möchte ich meinen Datenbestand nicht noch einmal einlesen müssen, oder mit viel Geld/Mühe nachträglich ein Klangdefizit korrigieren.
Also: Ich möchte möglichst gutes "Rohmaterial" auf meinem NAS-Server haben, damit mein Ausgangsmaterial high-end-tauglich ist.

Ach ja, hat nach euer Erfahrung auch das Computerlaufwerk einen maßgeblichen Anteil an der Klangqualität? Maßgeblich soll heißen: Auch auf Anlagen unter 100.000 EUR hörbar

Vielen Dank, Peter