Probleme mit VC-1 Filmen

Hallo erstmal, bin Neuling hier.

Ich schraube seit nunmehr 8 Wochen an einem HTPC rum und komme bei einem Problem einfach nicht weiter:

HD-Filme mit dem VC-1 Codec und AC3-Ton laufen einfach nicht sauber:
1) Abspielen mit PowerDVD8 (neuester Patch): Film ruckelt
2) Abspielen mit WMP11: Film läuft rund, Player stürzt aber nach ca. 45 Sekunden einfach ab

Was mich komplett irritiert:
Der demuxxte Stream, also der nackte VC-1-Stream läuft völlig rund. Das Problem tritt nur nach dem Muxxen auf.

Allerdings:
AVC(MPEG-4)/AC3 HD Filme laufen auf allen Filmen glöckchenrein.
Auch sonst läuft (mittlerweile) bei dem System alles problemfrei (HDMI Out,

Zum System:
OS = XP Pro/SP3 (durchaktualisiert)
Codecpack: Neuestes K-Lite-Mega (Defaults nach Profil "Lots of Stuff without Player")
Sonstige Codec-verdächtige installierte Software: PowerDVD8, WMP11, Super, Xilisoft HD Converter, TS Muxxer, QT Pro, Eac3to, AnyDVD HD, MediaInfo, AviSynth,MKVtoolnix

Hardware:
Intel DG45ID (onboard sound+grafik für HD Media, HDMI out)
Intel Core 2 Duo @ 2.53GHz
SATA II-HDs
4 Gig RAM
BIOS und HW Systemtreiber alle auf dem neuesten Stand.

Hilfreich wäre für mich schon, ein Tool zu finden, mit dem ich VC-1 Streams nach MPEG-4 (AVC) konvertieren kann.